(一)熟悉结算规则。查阅招投标文件和合同协议，特别是计量条款，风险约定，答疑文件等。关注完工结算的编制是否符合合同、招投标文件的约定，有无擅 自更改结算原则的问题;签订的补充协议是否和主合同有实质性的违背条款，如果要更改结算原则，理由是否真实、合理，手续是否合规完善。根据合同法，当事人 订立建设工程合同，采取要约、承诺方式，从合同法作为民法角度来看，招标公告和招标文件是要约邀请，投标文件是要约，中标通知书是承诺。审计人员要从建设 单位和施工单位开工前的要约和承诺内容入手，对招标文件、投标文件、补遗书、合同文本、补充协议等进行详细研究，对照全部工程实际结算资料，检查是否有前 后矛盾、自相矛盾、违背招投标和合同承诺内容的计量和支付的情况，若招标文件与投标文件存在不一致的地方，以投标文件为准。
如，某铁路项目隧道工程施工单位在经过对施工图设计、工程量清单、招标文件技术条款及招标答疑等资料仔细分析、充分理解和施工现场勘查考察后投标中标 签订合同协议书，施工单位应该承担单价风险，而业主却在变更批复中对合同内固定单价合同项目微新岩石明挖25.9万立方米按合同外变更项目保护层(工艺相 对微新岩石明挖复杂)给予施工单位815万元价差补偿，这有悖于双方所签合同相关条款。
(二)复核工程计量。根据图纸和结算书做到逐一审核，逐项核查工程量的计算是否符合工程量计算规则、是否准确，有无高估冒算，对于和定额子目不符项目 的换算是否准确，定额子目套用是否合理，有无就高的现象，计算公式的数字运算是否正确，有无故意计算和合计错误以及笔误，变更增加的项目是否已包括在原有 项目的工作内容中，防止重复计算，对每项工程量审核过程和结果要有记录，并经业主、监理、施工方签字认可。
如，某机场工程项目完工结算表中地形调整挖方工程量56.9万立方米，而现场签证单中挖方工程量共计41.8万立方米，结算工作量比签证工作量多 15.1万立方米，单价每立方米16元，多计价款241.6万元，签证工程量少而结算工程量多，纯粹是工程量的计算问题，或者是施工方故意多计工程量。
(三)剖析固定单价。对一些直接委托、独家议标、邀请招标、先施工后签合同的项目，要有重点抽查某些较高单价进行分析，看其组价是否合理，核减单价虚高部分。
如，某公路工程决算审核书中原道路机械破除25厘米厚砼外运1公里，单价分析表中费率为每平方米24元，采用手持风动凿岩机D8-11和D8-12子 目，其破除工程量80万平方米，如此大的工程量，在现在生产条件下不采用机械破除而采用人工破除不符合实际情况，人为增大工程成本，与鼓励先进技术淘汰落 后技术提高生产力相矛盾，实质是在保护落后技术，审计复核套用机械破除D8-25和D1-266子目，套用计算后单价为每平方米8元，核减造价1280万 元。
(四)认定材料价格。根据施工组织设计、施工日志、监理日记、收料点验单等资料确认使用材料品种、型号、规格，发包人供材根据购买情况要与财务审计相结合，承包人自购材料对照当地定额管理部门发布的施工时间段造价信息和市场调查询价相结合来确定市场价格。